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    黑龍江所“瓦氏雅羅魚極端鹽堿環(huán)境適應(yīng)的基因組基礎(chǔ)研究”取得重要進(jìn)展
    2021-07-29 10:06:41  來源:

    在國家重點研發(fā)計劃、國家自然科學(xué)基金、黑龍江省自然科學(xué)基金等項目的資助下,黑龍江水產(chǎn)研究所鯉科魚類基因組學(xué)團(tuán)隊常玉梅研究員等人開展的瓦氏雅羅魚在極端鹽堿環(huán)境下的適應(yīng)性分子機制研究取得重要進(jìn)展,相關(guān)研究成果“Resequencing and SNP discovery of Amur ide (Leuciscus waleckii) provides insights into local adaptations to extreme environments”發(fā)表于《Scientific Reports》(IF=4.379) (https://doi.org/10.1038/s41598-021-84652-5)。

    我國內(nèi)蒙古高原東部達(dá)里湖是典型的高碳酸鹽型半咸水湖泊,瓦氏雅羅魚達(dá)里湖種群與其它淡水種群不同,能夠耐受該湖極端的不良環(huán)境并形成優(yōu)勢種群,獨特的地質(zhì)和演化歷史使瓦氏雅羅魚成為了研究硬骨魚類適應(yīng)極端環(huán)境的理想模型。該研究采集了達(dá)里湖高堿耐受種群、鄰近姊妹湖崗更湖淡水種群、松花江淡水種群個體,從基因組尺度深入解析達(dá)里湖瓦氏雅羅魚極端鹽堿環(huán)境的適應(yīng)性機制。通過深度基因組重測序和遺傳變異信息的挖掘,消除空間背景差異聚焦異質(zhì)水環(huán)境,群體遺傳結(jié)構(gòu)和適應(yīng)性進(jìn)化研究發(fā)現(xiàn),一些與離子和滲透壓調(diào)節(jié)、血管發(fā)育、炎癥免疫反應(yīng)等過程相關(guān)的關(guān)鍵基因受到較強的正向選擇壓力,參與鹽堿局域適應(yīng)。其中達(dá)里湖種群的血管活性腸肽受體基因vipr1多個位點受到強選擇,使其編碼蛋白具有更高效的配體結(jié)構(gòu)域,可能通過VIPR1-PACAP/VIP-PRL-NCC軸參與Na+/Cl-離子轉(zhuǎn)運。

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    該研究揭示了達(dá)里湖瓦氏雅羅魚適應(yīng)極端環(huán)境的遺傳基礎(chǔ),也為耐堿魚類新品種選育提供了有價值、可利用的基因元件。

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