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    院生物中心在鯉抵抗嗜水氣單胞菌感染的分子機制方面取得新進展
    2021-10-08 13:58:03  來源:



    近日,院生物技術研究中心在鯉抵抗嗜水氣單胞菌感染的分子機制方面取得新進展,相關研究論文“Genomic features of common carp that are relevant for resistance against Aeromonas hydrophila infection”發表于水產類1區雜志《Aquaculture》(2020年JCR1區,IF=4.242)。該論文得到國家重點研發計劃(2018YFD0900102)中國水產科學研究院中央級公益性科研院所基本科研業務費專項資金(2018B003和2020TD24)資助。江炎亮副研究員為文章的第一及通訊作者,許建研究員為共同通訊作者。文章鏈接網址:https://authors.elsevier.com/sd/article/S0044-8486(21)01175-3.

    嗜水氣單胞菌是鯉魚養殖中危害最嚴重的致病菌之一。研究人員對易感和抗病的鯉魚進行全基因組重測序并開展全基因組關聯分析,定位8個與抗病性狀顯著關聯的SNP位點(圖1)進一步找到6個潛在關鍵基因均為免疫相關基因:rab26dcctrim71ptpn21muc5btrim258個顯著關聯的SNP中1個為非同義SNP,位于基因trim25外顯子區域,可引發Trim25蛋白二級結構改變(圖2),且該基因在嗜水氣單胞菌感染后的鯉魚脾臟中顯著上調表達。研究結果表明鯉在基因組水平上的遺傳差異決定了其抵抗細菌感染能力強弱,為全基因組選育抗病新品系提供了必要的分子基礎。


     

      圖1. Manhattan 結果展示

          圖2. Trim25 蛋白二級結構預測








     

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