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    黑龍江所“江鱈基因組資源開發與利用研究”取得重要進展
    2021-12-14 11:59:27  來源:

    江鱈(Lota lota)是鱈科(Gadidae)唯一的淡水種,廣泛分布在北緯45°以北的歐亞和北美的內陸水域或海灣,在中國僅分布于黑龍江水系及鴨綠江上游和新疆的額爾齊斯河,是高寒水域珍稀的經濟魚類。近期,在黑龍江省自然科學基金項目(LH 2019C089, LH2019C070)的資助下,黑龍江水產研究所在“江鱈基因組資源開發與利用研究”中取得重要進展,相關研究成果“Chromosome-Level Genome Assembly of the Burbot (Lota lota) Using Nanopore and Hi-C Technologies”發表于中科院JCR 2區期刊《Frontiers in Genetics》(IF=4.599)(https://doi.org/10.3389/fgene.2021.747552) 。

    該研究組裝了一個江鱈的高質量的染色體水平基因組,基因組大小估計為565.64 Mb,雜合度為0.5%,錨定在24條染色體上。共注釋得到21,672個蛋白編碼基因,構建的系統發育樹結果表明江鱈與大西洋鱈魚(Gadus morhua)的親緣關系最密切,分化時間約為4,921萬年前。

    江鱈高質量染色體水平的基因組的獲得,將為其生物學和進化研究以及遺傳改良等提供數據基礎,對江鱈基因組資源開發利用,以及自然資源保護、恢復和有效管理具有重要意義。

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