大黃魚是我國產(chǎn)量最高的海水養(yǎng)殖魚類，年產(chǎn)量超過25萬噸。隨著近幾年大黃魚產(chǎn)業(yè)的轉(zhuǎn)型升級以及深遠(yuǎn)海養(yǎng)殖的快速發(fā)展，優(yōu)良品種創(chuàng)制顯得尤為迫切。為解決產(chǎn)業(yè)難點(diǎn)，創(chuàng)建深遠(yuǎn)海養(yǎng)殖大黃魚精準(zhǔn)高效育種技術(shù)體系，中國水產(chǎn)科學(xué)研究院東海水產(chǎn)研究所海水養(yǎng)殖生物育種與可持續(xù)產(chǎn)出全國重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室大黃魚遺傳育種團(tuán)隊(duì)成功研發(fā)“東海芯1號”大黃魚15K基因組育種芯片。這是東海所為培育適宜深遠(yuǎn)海養(yǎng)殖大黃魚新品種所特制的種業(yè)芯片，且檢測+預(yù)測周期小于14天，檢測成本不超百元。

“東海芯1號”育種芯片是基于大黃魚速生、高肌肉彈性和抗流選育參考群體（每個(gè)群體樣本數(shù)量均≥300尾）高深度重測序數(shù)據(jù)及2000余尾液相芯片分型數(shù)據(jù)，結(jié)合GenoBaits?技術(shù)體系開發(fā)而成，包括1173個(gè)GWAS分析性狀關(guān)聯(lián)標(biāo)記，以及14119個(gè)基于遺傳連鎖關(guān)系挑選的基因組均勻分布的背景位點(diǎn)。該技術(shù)能夠?qū)崿F(xiàn)大黃魚快速、精準(zhǔn)、高效的分子育種，可加快育種過程，提高育種效率，進(jìn)一步推動大黃魚種業(yè)創(chuàng)新與產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展。

“東海芯1號”芯片由東海所與博瑞迪聯(lián)合研發(fā)，研發(fā)過程中得到了廈門大學(xué)徐鵬教授團(tuán)隊(duì)、中國水產(chǎn)科學(xué)研究院漁業(yè)工程研究所許建研究員團(tuán)隊(duì)的技術(shù)支持。該芯片具有基因組上均勻分布、高多態(tài)性等特點(diǎn)，可以實(shí)現(xiàn)高效的群體劃分、分子標(biāo)記輔助選育、全基因組選擇等諸多功能，部分性狀基因組選擇預(yù)測準(zhǔn)確度最高可達(dá)0.66，證明該芯片在基因組選育中具有較好的應(yīng)用前景。

近年來，東海所深化大黃魚全產(chǎn)業(yè)鏈聯(lián)合攻關(guān)，在育種方面與寧德市富發(fā)水產(chǎn)有限公司、廈門大學(xué)、中國水產(chǎn)科學(xué)研究院漁業(yè)工程研究所、浙江省舟山市水產(chǎn)研究所等單位合作，聚焦深遠(yuǎn)海養(yǎng)殖大黃魚種業(yè)需求，創(chuàng)制了多個(gè)大黃魚新種質(zhì)和新品系。