近日，Science China Life Sciences雜志在線發(fā)表了中國水產科學研究院黃海水產研究所陳松林院士團隊題為“Decoding fish genome starts new era of important traits study and molecular breeding in China”的綜述。該綜述總結了中國在魚類基因組研究和分子育種領域取得的重要進展，并對未來的研究方向進行了展望和探討。

水產養(yǎng)殖已成為全球農業(yè)增長最快的領域，水產食品對保障世界糧食安全和營養(yǎng)做出了日益重要的貢獻。中國是世界第一水產養(yǎng)殖大國，魚類是水產養(yǎng)殖的支柱產業(yè)之一，然而種質退化、病害頻發(fā)、生長緩慢等問題嚴重制約了魚類養(yǎng)殖業(yè)的可持續(xù)發(fā)展。

2014年1月，陳松林院士領銜一個國際合作團隊率先完成了重要海水養(yǎng)殖魚類——半滑舌鰨的全基因組測序和解析，論文在Nature Genetics發(fā)表，這不僅是我國發(fā)表的首個魚類基因組，也是世界上第一個比目魚類的基因組序列，實現了我國魚類基因組解析研究零的突破，標志著中國魚類及育種技術研究進入基因組時代。今年正值我國第一篇魚類基因組測序論文發(fā)表10周年，回顧總結10年來我國在魚類全基因組測序、重要性狀遺傳解析和分子育種技術建立與應用方面取得的重要進展和成果，對于推動魚類基因組育種技術的應用和種業(yè)發(fā)展具有重要意義。

截至2023年底，我國已完成并發(fā)表了60多種魚類的基因組測序和精細圖譜繪制論文，并基于這些基因組信息，開展了基因組進化、比較基因組學以及功能基因組學研究，發(fā)現了dmrt1等性別決定基因，解析了魚類生長發(fā)育、性別決定、抗病抗逆、變態(tài)、品質等重要經濟性狀的遺傳基礎，并在此基礎上，研制了“魚芯1號”等魚類抗病育種基因芯片，建立了基因組選擇和基因編輯育種技術，推動了魚類良種培育進程。

2014-2023年中國發(fā)表的魚類基因論文數目（圖中顯示每年發(fā)表的代表性物種）

該綜述總結了中國魚類全基因組精細圖譜繪制、重要性狀的組學分析和基因組育種技術的研究現狀、進展和未來發(fā)展方向，為水產研究學者、魚類育種學家和養(yǎng)殖從業(yè)人員提供了魚類基因組學研究和育種技術的綜合信息，有助于促進魚類重要經濟性狀的遺傳選育和良種創(chuàng)制，支撐魚類養(yǎng)殖產業(yè)的可持續(xù)發(fā)展。

該綜述第一作者為黃海所周茜研究員，通訊作者為陳松林院士。綜述的撰寫和發(fā)表得到了國家自然科學基金重點項目、國家農業(yè)生物育種重大專項、山東省重點研發(fā)計劃等項目的支持。

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https://doi.org/10.1007/s11427-023-2670-5