大口黑鱸是我國重要的淡水養殖品種，2023年全國養殖產量達到88.80萬噸，在國民經濟中占有重要地位。目前大口黑鱸國審新品種僅有2個，新品種的數量與大口黑鱸養殖產業規模不匹配。亟需開發新的新品種，尤其是具有抗逆等性狀的新品種。研發創制基因組芯片，可以為加速大口黑鱸的育種進程，提高育種效率奠定基礎。

中國水產科學研究院珠江水產研究所鱖鱸基因組學與選擇育種創新團隊與康普森生物技術有限公司合作，利用CAGT?（Compass Agriculture Genomic Technology）靶向捕獲測序技術，研發了具有自主知識產權的大口黑鱸50 K液相育種芯片“鱸芯1號”。該芯片可應用于大口黑鱸種質資源鑒定、遺傳多樣性評估、基因定位與挖掘鑒定、全基因組關聯分析、分子輔助定向改良和基因組育種等不同場景，為大口黑鱸遺傳研究和品種選育提供了高效基因型鑒定工具。利用該芯片將來可進一步研發低密度芯片，降低選育成本，助力大口黑鱸全基因組選育和良種創新研究。

該芯片位點多態性高、基因組分布均勻，位點在染色體上的平均覆蓋率為99.65%，平均間距17 Kb。性狀關聯位點豐富，芯片包括團隊前期研究篩選獲得的多個功能位點，可用于生長、性別和抗病毒等重要性狀的精準鑒定和生產應用?！镑|芯1號”技術性能優良，而且芯片穩定性好，基因分型準確度高，測試結果顯示平均位點檢出率達99.95%，重復樣本基因型平均一致率為99.95%。

負責“鱸芯1號”研發的核心成員包括崗位科學家高風英特聘研究員，董浚鍵助理研究員、孫成飛副研究員、葉星研究員等?！镑|芯1號”的研制得到國家特色淡水魚技術體系淡水鱸種質資源與品種改良崗位（CARS-46）、中國水產科學研究院基本科研業務費（2023TD95）等項目的支持。

圖1 大口黑鱸50 K育種芯片檢測試劑盒

圖2 大口黑鱸50K CAGT液相育種芯片標記位點在染色體上的分布

圖3 “鱸芯1號”檢測效果