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    華大研究院構(gòu)建出非洲肺魚呼吸器官細胞全景圖
    2023-09-15 13:20:26  來源:科技日報

    9月15日,記者從深圳華大生命科學(xué)研究院(以下簡稱華大研究院)了解到,該院基于華大智造自主研發(fā)的單細胞建庫測序平臺,構(gòu)建出迄今最完整的非洲肺魚呼吸器官細胞全景圖,為進一步探索脊椎動物演化之謎提供重要依據(jù)。研究成果于9月13日在線發(fā)表在《自然·通訊》期刊。

    非洲肺魚至今已在地球上存在4億多年,可在極端干旱的陸地上進入休眠狀態(tài),并持續(xù)數(shù)月乃至數(shù)年之久。作為現(xiàn)存最接近四足動物的近親,非洲肺魚被認為是破解脊椎動物從水生到陸生演化的關(guān)鍵物種。

    非洲肺魚肺(左)和鰓(右)細胞圖譜。受訪者供圖

    “非洲肺魚的進化地位比較特殊,研究其呼吸系統(tǒng)能夠反映脊椎動物登陸過程中的狀態(tài)變化。”華大研究院數(shù)字化地球研究所主任科學(xué)家范廣益介紹,“研究構(gòu)建的單細胞圖譜全面描述了非洲肺魚呼吸器官的細胞類型組成,為后續(xù)探索脊椎動物呼吸系統(tǒng)的進化和適應(yīng)提供了寶貴的資源。”

    據(jù)悉,研究團隊通過對來自非洲肺魚肺組織的53605個細胞和來自非洲肺魚鰓組織87347個細胞進行測序,構(gòu)建了迄今最完整的非洲肺魚呼吸器官高分辨率細胞全景圖,該研究是繼2021年華大研究院參與構(gòu)建全球首個非洲肺魚完整基因組后的又一代表性成果。

    實驗室誘導(dǎo)非洲肺魚夏眠。受訪者供圖

    范廣益介紹,研究團隊結(jié)合此前發(fā)表的非洲肺魚基因組數(shù)據(jù),通過對實驗室誘導(dǎo)夏眠33天的非洲肺魚和對照組取樣,在非洲肺魚肺和鰓中分別鑒定出14和22種細胞類型,并首次以高分辨率圖譜形式展現(xiàn)了非洲肺魚呼吸器官的細胞組成。

    另悉,研究團隊從細胞和基因表達調(diào)控層面進行物種間的比較分析。結(jié)果表明,盡管非洲肺魚的肺在結(jié)構(gòu)上較為原始,但其基本的細胞組成和關(guān)鍵基因表達與高等哺乳動物具有較高的相似性,具備高等哺乳動物肺的基本功能。該研究結(jié)果進一步證實了非洲肺魚與典型脊椎動物呼吸器官的同源性。

    范廣益表示,此次研究為陸地脊椎動物的演化,尤其是呼吸系統(tǒng)的演化提供了數(shù)據(jù)支撐。后續(xù),團隊將開展非洲肺魚呼吸系統(tǒng)相關(guān)的系列研究,希望為描述脊椎動物的演化過程提供更多關(guān)鍵證據(jù)。

     

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