日本從以前就有導(dǎo)入外來(lái)種之情形，由于和外來(lái)種共存之時(shí)期很長(zhǎng)，這對(duì)生物多樣性之保育產(chǎn)生若干影響，因此就侵略性的外來(lái)種，必須實(shí)施制度性的檢討措施。引用生物多樣性公約締約國(guó)會(huì)議，有關(guān)侵略性外來(lái)種的早日預(yù)防和因應(yīng)、防止暨移除指導(dǎo)原則，作為日本國(guó)內(nèi)外來(lái)種對(duì)策之基本概念。

以環(huán)境面的「費(fèi)用對(duì)效果」之觀點(diǎn)來(lái)看，防止帶來(lái)不良影響之外來(lái)種的定居附著，最為有效，倘侵入時(shí)早日排除之效果亦最高。(一)制度化時(shí)應(yīng)檢討事項(xiàng)應(yīng)教育國(guó)民有關(guān)外來(lái)魚種對(duì)策制度之基礎(chǔ)知識(shí)及概念。欲導(dǎo)入外來(lái)種時(shí)，應(yīng)提出有關(guān)生態(tài)之基礎(chǔ)訊息，并依據(jù)專家之意見，判定該物種對(duì)生物多樣性之影響程度。目前日本已判定若干外來(lái)種對(duì)生物多樣性之影響程度。對(duì)造成不良影響之外來(lái)種的導(dǎo)入，需采取適當(dāng)?shù)墓芾泶胧Ｓ脦?lái)不良影響之外來(lái)種之個(gè)體者，政府需設(shè)立機(jī)制，以采行適當(dāng)?shù)墓芾泶胧乐箓€(gè)體逃離造成不良影響。據(jù)此應(yīng)對(duì)個(gè)體施以適當(dāng)?shù)恼J(rèn)知方法。
對(duì)日本導(dǎo)入的外來(lái)種，需監(jiān)控其狀況，倘發(fā)生問(wèn)題時(shí)需采取緊急措施。有關(guān)非蓄意性導(dǎo)入之侵略性外來(lái)種，須檢討在高導(dǎo)入地區(qū)采取監(jiān)控方法。對(duì)在野外帶來(lái)問(wèn)題或可能帶來(lái)問(wèn)題之外來(lái)種，需設(shè)立計(jì)劃性的防止暨移除措施。政府應(yīng)以國(guó)家整體觀點(diǎn)，而地方公共團(tuán)體亦應(yīng)配合地區(qū)的實(shí)況，設(shè)立防止暨移除措施。在多數(shù)固有種生存的地區(qū)，以生物多樣性之觀點(diǎn)來(lái)看，有防止外來(lái)種產(chǎn)生影響之必要地區(qū)，需設(shè)立防止暨移除之特別管理措施。

除教育國(guó)民使其了解外來(lái)種對(duì)策之重要性，并和各教育機(jī)關(guān)合作，以確保教材和人才。有關(guān)外來(lái)種的附著地定居狀況，除推動(dòng)生物特性之基礎(chǔ)研究調(diào)查外，并開發(fā)防止暨移除以及監(jiān)控之技術(shù)。(二)制度化及實(shí)施對(duì)策實(shí)時(shí)應(yīng)注意事項(xiàng)
除確保預(yù)算和整頓體制外，由優(yōu)先度高的地區(qū)開始實(shí)施現(xiàn)有科學(xué)研究和體制之可行性調(diào)查。

留意現(xiàn)有各種制度之整合性，建構(gòu)處理外來(lái)種問(wèn)題之合作機(jī)制，推動(dòng)綜合性和有效性之對(duì)策。政府應(yīng)支持地方公共團(tuán)體配合地區(qū)的實(shí)況，推動(dòng)外來(lái)種對(duì)策。已到防止暨移除之狀況時(shí)，需充分認(rèn)知其是否為原本管理下不會(huì)喪失之生命體，并在建構(gòu)制度時(shí)，以預(yù)防性觀點(diǎn)加以檢討。檢討輸入之相關(guān)制度時(shí)，要留意和會(huì)員國(guó)間之WTO協(xié)議之關(guān)系。